More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2797 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2797  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
557 aa  1134    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  35.79 
 
 
568 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
577 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  32.8 
 
 
554 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  33.67 
 
 
678 aa  267  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  31.84 
 
 
576 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  32.19 
 
 
541 aa  263  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  31.05 
 
 
573 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1201  Pyrrolo-quinoline quinone  31.08 
 
 
545 aa  256  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.817213  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.48 
 
 
576 aa  247  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  32.8 
 
 
579 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  33.64 
 
 
575 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  33.89 
 
 
570 aa  243  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.46 
 
 
575 aa  243  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
575 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.72 
 
 
575 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.99 
 
 
595 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  31.99 
 
 
595 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  31.99 
 
 
595 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.9 
 
 
573 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  32.9 
 
 
573 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  32.9 
 
 
573 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  30.49 
 
 
583 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.72 
 
 
575 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0849  Pyrrolo-quinoline quinone  31.4 
 
 
528 aa  233  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.51 
 
 
582 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  32.35 
 
 
591 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  28.09 
 
 
614 aa  231  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.52 
 
 
584 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2326  putative quinoprotein  31.37 
 
 
525 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.55919  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.02 
 
 
584 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  31.94 
 
 
580 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.74 
 
 
613 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.23 
 
 
597 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.8 
 
 
587 aa  226  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  31.89 
 
 
702 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  32.39 
 
 
580 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.84 
 
 
587 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  31.09 
 
 
604 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.84 
 
 
587 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.51 
 
 
605 aa  224  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  31.28 
 
 
592 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  33.07 
 
 
549 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  32.12 
 
 
580 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 
602 aa  217  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  30.68 
 
 
572 aa  216  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.77 
 
 
589 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4951  Pyrrolo-quinoline quinone  31.98 
 
 
577 aa  214  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
561 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.77 
 
 
588 aa  213  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  30.06 
 
 
616 aa  211  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
587 aa  210  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  32.18 
 
 
593 aa  210  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.54 
 
 
613 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  28.9 
 
 
611 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
623 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  30.62 
 
 
705 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  29.27 
 
 
721 aa  209  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  29.58 
 
 
587 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  29.96 
 
 
718 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.41 
 
 
707 aa  206  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  28.88 
 
 
562 aa  206  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.92 
 
 
623 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0779  methanol dehydrogenase protein, large subunit  29.62 
 
 
601 aa  205  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0879687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  28.45 
 
 
620 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4524  Pyrrolo-quinoline quinone  27.18 
 
 
612 aa  203  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.17 
 
 
631 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.89 
 
 
579 aa  203  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  30.39 
 
 
601 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4984  Pyrrolo-quinoline quinone  27.01 
 
 
612 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.257884 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  28.17 
 
 
562 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.6 
 
 
601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  27.23 
 
 
613 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.54 
 
 
606 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  27.29 
 
 
585 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0344  Pyrrolo-quinoline quinone  28.88 
 
 
623 aa  200  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.122301  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  27.67 
 
 
631 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  29.47 
 
 
620 aa  199  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  28.79 
 
 
631 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.61 
 
 
566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  26.9 
 
 
738 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  29.89 
 
 
601 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0673  PQQ-dependent enzyme-like protein  27.24 
 
 
569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.02 
 
 
602 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  29.05 
 
 
698 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  29.51 
 
 
706 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  29.97 
 
 
588 aa  197  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5977  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  28.55 
 
 
600 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.391325  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  28.67 
 
 
605 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5752  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.2 
 
 
599 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0649397 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 
600 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  28.52 
 
 
600 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  29.78 
 
 
601 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  28.54 
 
 
558 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  27.09 
 
 
600 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4210  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.27 
 
 
627 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719388  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  29.04 
 
 
615 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  28.65 
 
 
600 aa  194  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.81 
 
 
629 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0508  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.32 
 
 
601 aa  194  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619983  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>