268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2790 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0476  quinoprotein glucose dehydrogenase  51.83 
 
 
600 aa  639    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  56.38 
 
 
606 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  56.97 
 
 
601 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  52.84 
 
 
600 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0508  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  57.31 
 
 
601 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619983  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1809  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  57.56 
 
 
601 aa  679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  55.87 
 
 
605 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  55.42 
 
 
601 aa  667    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1761  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  57.31 
 
 
601 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5752  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  56.01 
 
 
599 aa  668    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0649397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5977  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  56.67 
 
 
600 aa  680    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.391325  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  52.61 
 
 
600 aa  641    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  54.66 
 
 
601 aa  667    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2145  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  57.56 
 
 
601 aa  679    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.885263  normal  0.307838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4972  Pyrrolo-quinoline quinone  56.57 
 
 
608 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.779778  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5444  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  55.82 
 
 
599 aa  673    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  52.84 
 
 
600 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  51.14 
 
 
600 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
615 aa  1263    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  57 
 
 
601 aa  686    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3393  putative methanol dehydrogenase protein, large subunit  54.56 
 
 
606 aa  632  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.078697  normal  0.0119159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4686  Pyrrolo-quinoline quinone  52.5 
 
 
607 aa  628  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.829526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  53.85 
 
 
608 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520136  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3106  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  52.32 
 
 
606 aa  625  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  51.76 
 
 
619 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0421  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  50.34 
 
 
590 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1932  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  51.41 
 
 
592 aa  596  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2082  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  50.97 
 
 
588 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.687191  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0779  methanol dehydrogenase protein, large subunit  49.74 
 
 
601 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0879687  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2260  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  49.19 
 
 
601 aa  560  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2044  Pyrrolo-quinoline quinone  46.82 
 
 
599 aa  557  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.115508  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0344  Pyrrolo-quinoline quinone  46.08 
 
 
623 aa  549  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.122301  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  46.46 
 
 
620 aa  551  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  47.71 
 
 
629 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1907  Pyrrolo-quinoline quinone  47.55 
 
 
624 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135977  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2314  Pyrrolo-quinoline quinone  47.9 
 
 
625 aa  538  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000100555  unclonable  0.000000320672 
 
 
 
NC_010505  Mrad2831_4210  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  46.39 
 
 
627 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719388  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  45.69 
 
 
604 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4150  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  46.87 
 
 
626 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383489  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2993  Pyrrolo-quinoline quinone  43.71 
 
 
632 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.391865  normal  0.445791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4632  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  47.18 
 
 
626 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4518  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  46.87 
 
 
626 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.966685  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1717  Pyrrolo-quinoline quinone  43.8 
 
 
620 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000584084  unclonable  0.000000429175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0471  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  44.03 
 
 
625 aa  511  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  43.51 
 
 
601 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  45.91 
 
 
613 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  44.01 
 
 
616 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  41.83 
 
 
613 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  43.64 
 
 
611 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  41.78 
 
 
605 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3149  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  41.44 
 
 
631 aa  463  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  39.58 
 
 
595 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  39.41 
 
 
595 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  40 
 
 
595 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.35 
 
 
587 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  40.62 
 
 
554 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  37.3 
 
 
591 aa  365  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.17 
 
 
587 aa  363  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.17 
 
 
587 aa  363  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.83 
 
 
589 aa  362  9e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  38.07 
 
 
587 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  41.78 
 
 
584 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.54 
 
 
579 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  41.59 
 
 
584 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  40.73 
 
 
579 aa  349  9e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  40.54 
 
 
580 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.13 
 
 
588 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
587 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  37.58 
 
 
580 aa  347  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.79 
 
 
602 aa  342  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  37.11 
 
 
602 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  39.16 
 
 
593 aa  332  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.07 
 
 
726 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.82 
 
 
582 aa  319  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.28 
 
 
707 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  38.92 
 
 
570 aa  318  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  36.73 
 
 
706 aa  315  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.07 
 
 
575 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  37.07 
 
 
575 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.76 
 
 
597 aa  313  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  35.75 
 
 
588 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  38.25 
 
 
549 aa  310  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  36.61 
 
 
702 aa  309  8e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
575 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37 
 
 
575 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  36.27 
 
 
721 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.68 
 
 
697 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  35.08 
 
 
738 aa  307  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  33.94 
 
 
720 aa  307  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.87 
 
 
575 aa  306  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  36.52 
 
 
726 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.43 
 
 
573 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  37.43 
 
 
573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  37.43 
 
 
573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  36.59 
 
 
730 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  35.91 
 
 
705 aa  303  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  37.26 
 
 
631 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.45 
 
 
724 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  37.26 
 
 
631 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.26 
 
 
631 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>