253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2082 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0508  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  68.77 
 
 
601 aa  860    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619983  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1761  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  68.42 
 
 
601 aa  855    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2082  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  100 
 
 
588 aa  1189    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.687191  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  56.13 
 
 
619 aa  673    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0476  quinoprotein glucose dehydrogenase  68.42 
 
 
600 aa  823    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  67.38 
 
 
601 aa  837    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  68.11 
 
 
601 aa  868    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  66.17 
 
 
600 aa  842    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1932  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  82.45 
 
 
592 aa  953    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  56.03 
 
 
606 aa  710    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  59.01 
 
 
605 aa  716    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0421  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  86.25 
 
 
590 aa  1051    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5444  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  67.45 
 
 
599 aa  859    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5977  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  68.01 
 
 
600 aa  869    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.391325  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  65.93 
 
 
600 aa  813    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  69.68 
 
 
601 aa  862    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2145  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  67.53 
 
 
601 aa  855    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.885263  normal  0.307838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4972  Pyrrolo-quinoline quinone  57.07 
 
 
608 aa  719    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.779778  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  58.49 
 
 
608 aa  704    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4686  Pyrrolo-quinoline quinone  70.49 
 
 
607 aa  840    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.829526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  62.21 
 
 
601 aa  809    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3393  putative methanol dehydrogenase protein, large subunit  55.72 
 
 
606 aa  702    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.078697  normal  0.0119159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3106  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  56.68 
 
 
606 aa  705    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  66.17 
 
 
600 aa  841    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  65.67 
 
 
600 aa  836    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1809  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  67.53 
 
 
601 aa  855    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5752  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  67.45 
 
 
599 aa  866    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0649397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2260  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  58.74 
 
 
601 aa  709    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0344  Pyrrolo-quinoline quinone  50.4 
 
 
623 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.122301  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  49.92 
 
 
615 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1717  Pyrrolo-quinoline quinone  49.92 
 
 
620 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000584084  unclonable  0.000000429175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0779  methanol dehydrogenase protein, large subunit  48.15 
 
 
601 aa  554  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0879687  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2314  Pyrrolo-quinoline quinone  47.39 
 
 
625 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000100555  unclonable  0.000000320672 
 
 
 
NC_008786  Veis_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  48.13 
 
 
620 aa  545  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2993  Pyrrolo-quinoline quinone  46.13 
 
 
632 aa  531  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.391865  normal  0.445791 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  47.74 
 
 
629 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771392  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2044  Pyrrolo-quinoline quinone  45.92 
 
 
599 aa  522  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.115508  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  49.65 
 
 
613 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4632  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  46.86 
 
 
626 aa  515  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4210  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  46.17 
 
 
627 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719388  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4518  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  46.52 
 
 
626 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.966685  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4150  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  46.52 
 
 
626 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383489  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0471  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  46.17 
 
 
625 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  47.42 
 
 
604 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1907  Pyrrolo-quinoline quinone  45.64 
 
 
624 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135977  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  47.24 
 
 
616 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  46.89 
 
 
601 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  46.63 
 
 
613 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  46.81 
 
 
611 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  45.57 
 
 
605 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3149  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  42.56 
 
 
631 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  38.32 
 
 
580 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  38.61 
 
 
579 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.28 
 
 
587 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.28 
 
 
587 aa  330  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.28 
 
 
587 aa  330  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.76 
 
 
584 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  38.32 
 
 
602 aa  326  8.000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.95 
 
 
584 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.27 
 
 
579 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  37.21 
 
 
580 aa  317  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  35.85 
 
 
554 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.96 
 
 
589 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.8 
 
 
582 aa  312  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.3 
 
 
597 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  35.82 
 
 
587 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.83 
 
 
595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  34.65 
 
 
595 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  34.47 
 
 
595 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  37.81 
 
 
549 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  34.68 
 
 
591 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  36.99 
 
 
702 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.32 
 
 
602 aa  301  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  36.47 
 
 
593 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.96 
 
 
588 aa  298  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
587 aa  296  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  37.04 
 
 
583 aa  296  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  36.05 
 
 
588 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.69 
 
 
576 aa  293  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.62 
 
 
726 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.68 
 
 
724 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  34.96 
 
 
721 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  35.71 
 
 
562 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  34.62 
 
 
570 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.21 
 
 
566 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  36.27 
 
 
726 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  35.26 
 
 
720 aa  280  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.78 
 
 
631 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  34.15 
 
 
705 aa  279  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
712 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.74 
 
 
697 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  34.6 
 
 
718 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  35.44 
 
 
730 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  35.14 
 
 
718 aa  277  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  33.61 
 
 
631 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  33.61 
 
 
631 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  33.95 
 
 
620 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  35.02 
 
 
709 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  35.13 
 
 
706 aa  275  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  35.65 
 
 
698 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>