More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1591 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  100 
 
 
583 aa  1199    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  41.87 
 
 
584 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  41.45 
 
 
584 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  42.03 
 
 
579 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  40.18 
 
 
589 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  41.17 
 
 
580 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  39.96 
 
 
602 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  40.07 
 
 
554 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  40.33 
 
 
576 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  41.58 
 
 
593 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  39.75 
 
 
582 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  39.79 
 
 
591 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  39.61 
 
 
595 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  39.43 
 
 
595 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  39.43 
 
 
595 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  40 
 
 
580 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  39.65 
 
 
588 aa  379  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  37.18 
 
 
620 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  38.52 
 
 
587 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.46 
 
 
587 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  38.65 
 
 
588 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.1 
 
 
587 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.1 
 
 
587 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  40.24 
 
 
602 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  38.94 
 
 
587 aa  365  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  39.32 
 
 
597 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  39.32 
 
 
592 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 
623 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.15 
 
 
579 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 
623 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.61 
 
 
631 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  40.4 
 
 
549 aa  350  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  36.61 
 
 
631 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  36.61 
 
 
631 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  40.67 
 
 
566 aa  347  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.57 
 
 
575 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 
575 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.71 
 
 
573 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.45 
 
 
575 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  37.29 
 
 
570 aa  330  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  36.54 
 
 
573 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  36.54 
 
 
573 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  37.45 
 
 
575 aa  330  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 
618 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.27 
 
 
575 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  38.39 
 
 
580 aa  317  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  39.63 
 
 
730 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  37.43 
 
 
705 aa  313  4.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  38 
 
 
616 aa  312  9e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  38.89 
 
 
601 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.26 
 
 
601 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  37.38 
 
 
600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  39.44 
 
 
726 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  37.38 
 
 
600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.49 
 
 
613 aa  306  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  37.69 
 
 
601 aa  306  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  35.96 
 
 
562 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  37.64 
 
 
600 aa  303  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  36.99 
 
 
709 aa  302  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  36.73 
 
 
601 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1932  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.15 
 
 
592 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  35.99 
 
 
738 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.65 
 
 
724 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
712 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  36.35 
 
 
600 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  35.24 
 
 
572 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2260  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.99 
 
 
601 aa  298  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.31 
 
 
611 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.74 
 
 
613 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2082  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.04 
 
 
588 aa  296  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.687191  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.91 
 
 
605 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4686  Pyrrolo-quinoline quinone  35.91 
 
 
607 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.829526 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0476  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.78 
 
 
600 aa  295  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.39 
 
 
601 aa  295  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
577 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.12 
 
 
707 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  35.7 
 
 
604 aa  294  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  34.96 
 
 
615 aa  293  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5444  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.29 
 
 
599 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0421  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.59 
 
 
590 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.97 
 
 
697 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4972  Pyrrolo-quinoline quinone  34.68 
 
 
608 aa  287  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.779778  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  33.9 
 
 
720 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  36.07 
 
 
718 aa  286  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  35.02 
 
 
706 aa  286  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  36.27 
 
 
568 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  36.16 
 
 
721 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0471  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.77 
 
 
625 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  32.84 
 
 
573 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4632  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.18 
 
 
626 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271906 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2993  Pyrrolo-quinoline quinone  33.79 
 
 
632 aa  283  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.391865  normal  0.445791 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  33.02 
 
 
576 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1761  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.82 
 
 
601 aa  282  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5977  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.02 
 
 
600 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.391325  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4150  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.78 
 
 
626 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383489  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4518  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.78 
 
 
626 aa  282  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.966685  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5752  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.36 
 
 
599 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0649397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  34.8 
 
 
619 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  36.85 
 
 
718 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  34.43 
 
 
620 aa  280  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>