297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4984 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4984  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
612 aa  1224    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.257884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  91.84 
 
 
613 aa  1108    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4524  Pyrrolo-quinoline quinone  97.88 
 
 
612 aa  1199    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  76.74 
 
 
585 aa  897    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  50.44 
 
 
614 aa  551  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
577 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  37.18 
 
 
576 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  37.68 
 
 
573 aa  375  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  36.3 
 
 
568 aa  347  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.53 
 
 
576 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  33.86 
 
 
718 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  32.82 
 
 
718 aa  269  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.39 
 
 
707 aa  267  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
712 aa  266  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.98 
 
 
724 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  32.06 
 
 
709 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  32.98 
 
 
554 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  32.52 
 
 
726 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.39 
 
 
697 aa  259  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  31.31 
 
 
570 aa  258  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  33.17 
 
 
738 aa  257  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  31.74 
 
 
595 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  31.82 
 
 
730 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.74 
 
 
595 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  31.57 
 
 
595 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  32.81 
 
 
706 aa  254  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  31.87 
 
 
591 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  31.62 
 
 
721 aa  253  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  31 
 
 
600 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  30.5 
 
 
600 aa  251  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  31.14 
 
 
600 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  32.15 
 
 
678 aa  245  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  32.69 
 
 
579 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  32.78 
 
 
698 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.71 
 
 
566 aa  243  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.28 
 
 
573 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  31.5 
 
 
573 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  31.5 
 
 
573 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  31.91 
 
 
702 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.2 
 
 
588 aa  239  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  30.14 
 
 
587 aa  239  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.62 
 
 
602 aa  237  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  31.79 
 
 
583 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  31.69 
 
 
727 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
587 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  30.92 
 
 
705 aa  233  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.8 
 
 
597 aa  233  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  30.55 
 
 
563 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.17 
 
 
726 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  32.3 
 
 
620 aa  230  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0849  Pyrrolo-quinoline quinone  31.13 
 
 
528 aa  230  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
561 aa  229  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  30.61 
 
 
580 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.46 
 
 
575 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  30.39 
 
 
575 aa  228  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
623 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
711 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.09 
 
 
575 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  29.23 
 
 
592 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  30.78 
 
 
602 aa  226  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.88 
 
 
606 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.8 
 
 
623 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  32 
 
 
720 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0421  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.46 
 
 
590 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  29.95 
 
 
580 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  30.6 
 
 
580 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.54 
 
 
587 aa  223  7e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.54 
 
 
587 aa  223  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  31.11 
 
 
604 aa  223  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  31.81 
 
 
616 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2227  Pyrrolo-quinoline quinone  30.41 
 
 
705 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  32.34 
 
 
575 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.7 
 
 
582 aa  222  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  30.99 
 
 
558 aa  223  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.07 
 
 
584 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  30.64 
 
 
572 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.17 
 
 
575 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  29.09 
 
 
562 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2082  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.86 
 
 
588 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.687191  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  31.83 
 
 
593 aa  220  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  29.84 
 
 
605 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.95 
 
 
737 aa  219  7.999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  31.01 
 
 
727 aa  219  8.999999999999998e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.51 
 
 
584 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  30.16 
 
 
620 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.45 
 
 
601 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.2 
 
 
587 aa  219  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4686  Pyrrolo-quinoline quinone  31.8 
 
 
607 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.829526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  30.15 
 
 
601 aa  218  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2993  Pyrrolo-quinoline quinone  29.39 
 
 
632 aa  217  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.391865  normal  0.445791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
618 aa  217  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  31.17 
 
 
631 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  31.17 
 
 
631 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.3 
 
 
631 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4150  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.98 
 
 
626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383489  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4632  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.2 
 
 
626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4518  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.98 
 
 
626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.966685  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  30.11 
 
 
541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1932  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.62 
 
 
592 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  29.65 
 
 
601 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>