More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2326 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2326  putative quinoprotein  100 
 
 
525 aa  1058    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.55919  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0849  Pyrrolo-quinoline quinone  53.29 
 
 
528 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  47.08 
 
 
678 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  41.32 
 
 
541 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1201  Pyrrolo-quinoline quinone  38.34 
 
 
545 aa  346  6e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.817213  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
577 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  34.17 
 
 
576 aa  274  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  34.15 
 
 
554 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  33.7 
 
 
573 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.42 
 
 
576 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  33.2 
 
 
570 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.44 
 
 
573 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  32.44 
 
 
573 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  32.44 
 
 
573 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  33.2 
 
 
575 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  31.02 
 
 
568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  33.08 
 
 
592 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  33.27 
 
 
583 aa  236  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2797  Pyrrolo-quinoline quinone  32.35 
 
 
557 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  31.46 
 
 
575 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.46 
 
 
575 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
561 aa  220  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.24 
 
 
575 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.52 
 
 
575 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4524  Pyrrolo-quinoline quinone  30.63 
 
 
612 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  30.41 
 
 
585 aa  217  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  33.2 
 
 
572 aa  217  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.7 
 
 
566 aa  213  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4984  Pyrrolo-quinoline quinone  30.3 
 
 
612 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.257884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  29.54 
 
 
562 aa  208  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  32.14 
 
 
580 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  30.19 
 
 
738 aa  207  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  29.77 
 
 
558 aa  206  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  31.08 
 
 
613 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  31.01 
 
 
563 aa  205  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3660  putative alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
555 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  28.65 
 
 
562 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  28.74 
 
 
614 aa  199  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  32.93 
 
 
579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.55 
 
 
707 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  30.84 
 
 
705 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  29.45 
 
 
721 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  30.59 
 
 
602 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  31.98 
 
 
580 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  30.4 
 
 
616 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
711 aa  189  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  31.56 
 
 
698 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 
712 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.8 
 
 
724 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  29.95 
 
 
727 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.31 
 
 
597 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  29.41 
 
 
718 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  30.29 
 
 
726 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.45 
 
 
584 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.45 
 
 
584 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  31.05 
 
 
720 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  27.88 
 
 
600 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  29.82 
 
 
591 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  28.46 
 
 
718 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  30.1 
 
 
730 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  30.59 
 
 
595 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  30.36 
 
 
727 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  30.2 
 
 
595 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  28.5 
 
 
631 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.39 
 
 
595 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  30.06 
 
 
620 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  28.5 
 
 
631 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  28.67 
 
 
601 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.4 
 
 
697 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  30.98 
 
 
588 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  28.76 
 
 
601 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  29.01 
 
 
601 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.45 
 
 
631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3106  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.32 
 
 
606 aa  180  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 
709 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
623 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.23 
 
 
602 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.4 
 
 
601 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  27.16 
 
 
600 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  29.34 
 
 
587 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  27.16 
 
 
600 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 
623 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  29.73 
 
 
604 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0476  quinoprotein glucose dehydrogenase  26.48 
 
 
600 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  28.4 
 
 
706 aa  177  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 
587 aa  177  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  28.68 
 
 
613 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.57 
 
 
737 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.82 
 
 
588 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  30.2 
 
 
580 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  26.8 
 
 
600 aa  174  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2890  Pyrrolo-quinoline quinone  28.54 
 
 
583 aa  173  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612512  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  28.1 
 
 
615 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.75 
 
 
726 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.29 
 
 
605 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  30.4 
 
 
593 aa  171  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1717  Pyrrolo-quinoline quinone  27.49 
 
 
620 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000584084  unclonable  0.000000429175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  28.1 
 
 
611 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.43 
 
 
582 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.39 
 
 
606 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>