270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2890 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2890  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
583 aa  1195    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612512  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  34.94 
 
 
572 aa  297  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  36.67 
 
 
580 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  32.26 
 
 
708 aa  279  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  34.43 
 
 
554 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.87 
 
 
576 aa  267  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  32.92 
 
 
705 aa  257  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  32.83 
 
 
570 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.32 
 
 
566 aa  254  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.4 
 
 
589 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  33.1 
 
 
563 aa  253  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  31.13 
 
 
587 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  32.07 
 
 
602 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.9 
 
 
595 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  33.16 
 
 
579 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  30.73 
 
 
595 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
587 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  30.73 
 
 
595 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.27 
 
 
631 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  30.11 
 
 
631 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  30.89 
 
 
620 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.42 
 
 
588 aa  237  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  30.56 
 
 
631 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.5 
 
 
573 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  30.5 
 
 
573 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  30.5 
 
 
573 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  30.3 
 
 
718 aa  236  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.12 
 
 
575 aa  236  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  32.85 
 
 
588 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  31.83 
 
 
583 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  29.61 
 
 
592 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.07 
 
 
587 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  31.8 
 
 
738 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 
623 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.91 
 
 
575 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.65 
 
 
587 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.33 
 
 
579 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.65 
 
 
587 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  30.94 
 
 
591 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
623 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  32.21 
 
 
730 aa  230  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  31.52 
 
 
562 aa  229  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.15 
 
 
584 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  30.82 
 
 
575 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.65 
 
 
575 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.98 
 
 
584 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  30.24 
 
 
580 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  31 
 
 
580 aa  224  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
712 aa  224  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  32.21 
 
 
726 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  30.78 
 
 
721 aa  223  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
575 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  31.76 
 
 
718 aa  223  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
561 aa  223  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.98 
 
 
724 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  32.33 
 
 
706 aa  223  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  31.52 
 
 
600 aa  220  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  31.03 
 
 
562 aa  219  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 
698 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.03 
 
 
582 aa  216  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 
577 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.43 
 
 
602 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.76 
 
 
597 aa  214  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  29.71 
 
 
541 aa  213  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  31.57 
 
 
558 aa  213  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.42 
 
 
707 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.95 
 
 
726 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.32 
 
 
697 aa  208  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0476  quinoprotein glucose dehydrogenase  30.5 
 
 
600 aa  206  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4951  Pyrrolo-quinoline quinone  29.9 
 
 
577 aa  203  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97328 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  27.59 
 
 
727 aa  203  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  30.74 
 
 
600 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  31.75 
 
 
593 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  29.47 
 
 
709 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  29.91 
 
 
678 aa  202  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  30.74 
 
 
600 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  29.39 
 
 
601 aa  200  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  28.86 
 
 
702 aa  199  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.13 
 
 
618 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  27.84 
 
 
737 aa  197  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  30.34 
 
 
549 aa  196  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  30.91 
 
 
601 aa  195  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  30.61 
 
 
616 aa  194  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  27.99 
 
 
711 aa  193  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  28 
 
 
727 aa  193  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3660  putative alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
555 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.15 
 
 
601 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  28.06 
 
 
573 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2082  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.64 
 
 
588 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.687191  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4160  Pyrrolo-quinoline quinone  28.42 
 
 
690 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0349949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  29.03 
 
 
615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  30.81 
 
 
604 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  29.14 
 
 
576 aa  191  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.59 
 
 
606 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  28.33 
 
 
619 aa  189  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  28.92 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  28.99 
 
 
600 aa  186  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1201  Pyrrolo-quinoline quinone  27.6 
 
 
545 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.817213  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  30.04 
 
 
601 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  29.72 
 
 
720 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>