More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4524 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4524  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
612 aa  1225    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  90.86 
 
 
613 aa  1097    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  77.42 
 
 
585 aa  907    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4984  Pyrrolo-quinoline quinone  97.88 
 
 
612 aa  1199    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.257884 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  50.44 
 
 
614 aa  550  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  38.57 
 
 
577 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  37.18 
 
 
576 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  37.85 
 
 
573 aa  375  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  36.13 
 
 
568 aa  346  6e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.19 
 
 
576 aa  270  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  32.87 
 
 
718 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  32.34 
 
 
718 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
712 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  32.62 
 
 
554 aa  258  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.41 
 
 
707 aa  257  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.1 
 
 
697 aa  255  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  31.4 
 
 
570 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  31.74 
 
 
595 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.81 
 
 
724 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  31.57 
 
 
595 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.74 
 
 
595 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  31.82 
 
 
726 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  31.46 
 
 
709 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 
738 aa  252  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  32.66 
 
 
678 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  31.65 
 
 
730 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  31.24 
 
 
721 aa  247  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  32.34 
 
 
706 aa  246  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  31.53 
 
 
591 aa  246  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  30.83 
 
 
600 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  30.33 
 
 
600 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  31.14 
 
 
600 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  32.78 
 
 
698 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.45 
 
 
573 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  31.68 
 
 
573 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  31.68 
 
 
573 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.18 
 
 
566 aa  239  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  30.81 
 
 
705 aa  237  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  31.54 
 
 
579 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.95 
 
 
588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
587 aa  233  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  31.45 
 
 
702 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  29.75 
 
 
587 aa  232  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0849  Pyrrolo-quinoline quinone  31.53 
 
 
528 aa  231  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.27 
 
 
602 aa  231  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  30.71 
 
 
563 aa  229  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  30.91 
 
 
583 aa  229  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.09 
 
 
575 aa  228  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.32 
 
 
726 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  31.19 
 
 
727 aa  227  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
561 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 
575 aa  227  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  31.95 
 
 
620 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  28.91 
 
 
592 aa  226  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.84 
 
 
575 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.45 
 
 
597 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0421  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.62 
 
 
590 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  30.1 
 
 
580 aa  223  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.44 
 
 
623 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  32.21 
 
 
575 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  32 
 
 
720 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2082  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.02 
 
 
588 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.687191  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  29.75 
 
 
580 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.55 
 
 
606 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.04 
 
 
575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  30.82 
 
 
558 aa  221  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
711 aa  221  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  29.47 
 
 
620 aa  221  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 
602 aa  220  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.46 
 
 
623 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.95 
 
 
737 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.53 
 
 
582 aa  219  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  31.01 
 
 
727 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4686  Pyrrolo-quinoline quinone  31.89 
 
 
607 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.829526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.18 
 
 
601 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  31.46 
 
 
616 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  30.44 
 
 
580 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2993  Pyrrolo-quinoline quinone  29.55 
 
 
632 aa  218  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.391865  normal  0.445791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2326  putative quinoprotein  30.63 
 
 
525 aa  217  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.55919  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  29.07 
 
 
562 aa  216  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.27 
 
 
587 aa  216  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.27 
 
 
587 aa  216  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  29.98 
 
 
601 aa  216  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  29.07 
 
 
605 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  30.62 
 
 
541 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  30.78 
 
 
604 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  30.24 
 
 
572 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1932  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.97 
 
 
592 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  29.14 
 
 
562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  31.1 
 
 
593 aa  213  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.39 
 
 
584 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2227  Pyrrolo-quinoline quinone  29.88 
 
 
705 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 
618 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  29.43 
 
 
601 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.11 
 
 
587 aa  211  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4210  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.3 
 
 
627 aa  211  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719388  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  28.84 
 
 
584 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1907  Pyrrolo-quinoline quinone  29.75 
 
 
624 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135977  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  30.3 
 
 
631 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 
631 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>