More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1201 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1201  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
545 aa  1111    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.817213  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  41.83 
 
 
541 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  41.34 
 
 
678 aa  398  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2326  putative quinoprotein  38.34 
 
 
525 aa  346  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.55919  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0849  Pyrrolo-quinoline quinone  37.14 
 
 
528 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  33.14 
 
 
576 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 
577 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2797  Pyrrolo-quinoline quinone  31.08 
 
 
557 aa  257  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  32.6 
 
 
554 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  31.76 
 
 
573 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  31.19 
 
 
573 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.19 
 
 
573 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  31.19 
 
 
573 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
561 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  31.59 
 
 
575 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.39 
 
 
575 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.84 
 
 
576 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  30.92 
 
 
570 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  30.93 
 
 
568 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  30.16 
 
 
575 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.38 
 
 
575 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  32.06 
 
 
558 aa  226  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  29.79 
 
 
592 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.57 
 
 
575 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  29.4 
 
 
572 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  30.69 
 
 
585 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.17 
 
 
566 aa  209  9e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3660  putative alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
555 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  29.96 
 
 
738 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 
614 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  28.24 
 
 
705 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4524  Pyrrolo-quinoline quinone  28.03 
 
 
612 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  26.77 
 
 
580 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4984  Pyrrolo-quinoline quinone  27.26 
 
 
612 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.257884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 
563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  29.34 
 
 
562 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  30.65 
 
 
718 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  29.9 
 
 
721 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  29.06 
 
 
709 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  26.97 
 
 
613 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4951  Pyrrolo-quinoline quinone  28.54 
 
 
577 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.98 
 
 
707 aa  190  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  29.55 
 
 
602 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  28.41 
 
 
730 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  27.76 
 
 
601 aa  188  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  28.68 
 
 
718 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.38 
 
 
724 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  27.8 
 
 
562 aa  187  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  28.54 
 
 
726 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.63 
 
 
601 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2890  Pyrrolo-quinoline quinone  27.71 
 
 
583 aa  183  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612512  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  29.28 
 
 
706 aa  183  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 
579 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  27.31 
 
 
616 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.97 
 
 
613 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  27.55 
 
 
580 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 
712 aa  180  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  27.89 
 
 
620 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  28.21 
 
 
580 aa  179  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  27.44 
 
 
595 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  28.33 
 
 
697 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.44 
 
 
595 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  26.07 
 
 
600 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  27.44 
 
 
595 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  27.24 
 
 
604 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  28.11 
 
 
587 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  28.29 
 
 
591 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  26.29 
 
 
600 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  26.29 
 
 
600 aa  177  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  27.75 
 
 
702 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  27.92 
 
 
698 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.93 
 
 
605 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  27.29 
 
 
584 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  27.56 
 
 
601 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  28.35 
 
 
583 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.27 
 
 
726 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0476  quinoprotein glucose dehydrogenase  26.77 
 
 
600 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  27.29 
 
 
584 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  27.58 
 
 
601 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  28.31 
 
 
737 aa  171  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  26.44 
 
 
588 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.85 
 
 
582 aa  170  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
587 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2044  Pyrrolo-quinoline quinone  25.05 
 
 
599 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.115508  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3393  putative methanol dehydrogenase protein, large subunit  25.51 
 
 
606 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.078697  normal  0.0119159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.85 
 
 
611 aa  169  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  27 
 
 
601 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  27.11 
 
 
615 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.35 
 
 
602 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  25.95 
 
 
600 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  26.8 
 
 
613 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5444  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  27.08 
 
 
599 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  26.84 
 
 
587 aa  163  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.84 
 
 
587 aa  163  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  27.68 
 
 
597 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0673  PQQ-dependent enzyme-like protein  26.72 
 
 
569 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.84 
 
 
587 aa  161  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  25.84 
 
 
605 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4518  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.24 
 
 
626 aa  161  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.966685  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.27 
 
 
629 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>