More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0851 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
558 aa  1144    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  84.92 
 
 
561 aa  941    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  52.14 
 
 
562 aa  608  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3660  putative alcohol dehydrogenase  54.53 
 
 
555 aa  586  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.25 
 
 
576 aa  332  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  35.79 
 
 
554 aa  306  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  36.28 
 
 
572 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  35.02 
 
 
592 aa  290  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.4 
 
 
726 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  32.99 
 
 
580 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  34.13 
 
 
595 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.13 
 
 
595 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  35.51 
 
 
705 aa  286  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  33.95 
 
 
595 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.22 
 
 
587 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  33.58 
 
 
591 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.92 
 
 
707 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  36.92 
 
 
580 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.84 
 
 
737 aa  281  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  31.4 
 
 
580 aa  281  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.17 
 
 
587 aa  280  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.17 
 
 
587 aa  280  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  35.06 
 
 
720 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  33.27 
 
 
602 aa  277  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  33.39 
 
 
631 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  33.39 
 
 
631 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.75 
 
 
631 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.36 
 
 
697 aa  276  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 
575 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  34.14 
 
 
702 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  35.06 
 
 
583 aa  272  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.43 
 
 
724 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.93 
 
 
582 aa  271  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.84 
 
 
597 aa  270  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  33.83 
 
 
579 aa  269  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  33.58 
 
 
573 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  33.58 
 
 
573 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.69 
 
 
589 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  33.52 
 
 
738 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.24 
 
 
575 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
711 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.4 
 
 
573 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.41 
 
 
584 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  33.46 
 
 
706 aa  267  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.83 
 
 
575 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.42 
 
 
584 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  33.83 
 
 
575 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  34.6 
 
 
718 aa  266  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  33.27 
 
 
718 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
575 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  34.12 
 
 
727 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.36 
 
 
588 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  34.14 
 
 
726 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  33.74 
 
 
562 aa  265  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 
620 aa  264  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4951  Pyrrolo-quinoline quinone  33.39 
 
 
577 aa  263  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97328 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  32.29 
 
 
587 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  31.38 
 
 
588 aa  262  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 
623 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
712 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  35.15 
 
 
568 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  33.71 
 
 
570 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  33.96 
 
 
698 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.2 
 
 
579 aa  261  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 
623 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  33.83 
 
 
730 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  32.98 
 
 
727 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  34.19 
 
 
678 aa  256  7e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  34.03 
 
 
615 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0779  methanol dehydrogenase protein, large subunit  33.15 
 
 
601 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0879687  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  33.65 
 
 
721 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.11 
 
 
606 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.55 
 
 
602 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  32.44 
 
 
709 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2227  Pyrrolo-quinoline quinone  32.74 
 
 
705 aa  249  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2260  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.25 
 
 
601 aa  249  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  33.27 
 
 
541 aa  249  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
587 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.28 
 
 
566 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  31.18 
 
 
605 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  32.34 
 
 
549 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3393  putative methanol dehydrogenase protein, large subunit  33.1 
 
 
606 aa  247  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.078697  normal  0.0119159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  31.99 
 
 
593 aa  246  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0344  Pyrrolo-quinoline quinone  29.52 
 
 
623 aa  246  8e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.122301  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2044  Pyrrolo-quinoline quinone  31.2 
 
 
599 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.115508  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  31.69 
 
 
600 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.57 
 
 
601 aa  244  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  32.21 
 
 
601 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3106  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.38 
 
 
606 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  31.18 
 
 
600 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.1 
 
 
608 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  31.18 
 
 
600 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  32.85 
 
 
563 aa  241  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  31.46 
 
 
616 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.54 
 
 
618 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2314  Pyrrolo-quinoline quinone  29.92 
 
 
625 aa  239  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000100555  unclonable  0.000000320672 
 
 
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
577 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  32.35 
 
 
601 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  33.21 
 
 
601 aa  238  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1907  Pyrrolo-quinoline quinone  29.95 
 
 
624 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135977  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>