252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00122 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00123  glucose dehydrogenase  100 
 
 		 796 aa  1630    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3478  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  99.87 
 
 		 796 aa  1629    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1444  glucose dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone)  47.56 
 
 		 803 aa  717    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0992  Pyrrolo-quinoline quinone  45.5 
 
 		 779 aa  676    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00168374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0856  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  47.06 
 
 		 779 aa  710    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337612  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4196  glucose dehydrogenase  47.31 
 
 		 747 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3930  quinoprotein  46.53 
 
 		 807 aa  726    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000484282 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1237  quinoprotein glucose dehydrogenase  41.89 
 
 		 844 aa  667    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4277  Pyrrolo-quinoline quinone  47.56 
 
 		 803 aa  716    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4577  quinoprotein glucose dehydrogenase  46.85 
 
 		 803 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2673  quinoprotein glucose dehydrogenase  48.3 
 
 		 781 aa  731    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0595  quinoprotein glucose dehydrogenase  47.91 
 
 		 776 aa  707    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0134  quinoprotein glucose dehydrogenase  99.87 
 
 		 796 aa  1629    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0188  quinoprotein glucose dehydrogenase  92.96 
 
 		 796 aa  1458    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.683326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1505  quinoprotein glucose dehydrogenase  65.97 
 
 		 809 aa  1083    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.900806  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0173  quinoprotein glucose dehydrogenase  67.75 
 
 		 799 aa  1082    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7581  quinoprotein glucose dehydrogenase  57.55 
 
 		 799 aa  914    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0184  quinoprotein glucose dehydrogenase  92.9 
 
 		 747 aa  1373    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.23859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0980  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  47.31 
 
 		 779 aa  738    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.804184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3525  quinoprotein glucose dehydrogenase  42.41 
 
 		 852 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0193  quinoprotein glucose dehydrogenase  92.77 
 
 		 747 aa  1372    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5020  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  46.48 
 
 		 812 aa  726    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34970  glucose dehydrogenase  47.5 
 
 		 803 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00222942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1775  Pyrrolo-quinoline quinone  41.06 
 
 		 854 aa  645    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00122  hypothetical protein  100 
 
 		 796 aa  1630    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.793225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3086  glucose dehydrogenase  46.34 
 
 		 775 aa  696    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596873  normal  0.134716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0411  quinoprotein glucose dehydrogenase  44.46 
 
 		 856 aa  741    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0132  quinoprotein glucose dehydrogenase  100 
 
 		 796 aa  1630    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0294  Pyrrolo-quinoline quinone  47.66 
 
 		 776 aa  733    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0342  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  42.01 
 
 		 868 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40050  Quinoprotein glucose dehydrogenase  46.29 
 
 		 801 aa  683    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1682  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  64.2 
 
 		 837 aa  1073    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404284  normal  0.183517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2843  glucose dehydrogenase  49.21 
 
 		 777 aa  750    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3535  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  100 
 
 		 796 aa  1630    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3100  quinoprotein glucose dehydrogenase  73.43 
 
 		 791 aa  1185    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1330  quinoprotein glucose dehydrogenase  48.17 
 
 		 781 aa  732    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0185  quinoprotein glucose dehydrogenase  92.77 
 
 		 747 aa  1372    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.266992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1211  quinoprotein glucose dehydrogenase  47.55 
 
 		 777 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471268  normal  0.152671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2951  glucose dehydrogenase  47.37 
 
 		 803 aa  723    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.734246  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0672  quinoprotein glucose dehydrogenase  89.7 
 
 		 796 aa  1472    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.570981  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0791  quinoprotein glucose dehydrogenase  45.76 
 
 		 806 aa  713    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0126  glucose dehydrogenase  100 
 
 		 796 aa  1630    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0128  glucose dehydrogenase  99.62 
 
 		 796 aa  1626    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126967  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0201  quinoprotein glucose dehydrogenase  92.9 
 
 		 747 aa  1371    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4361  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  47.82 
 
 		 803 aa  723    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691425  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1081  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  48.01 
 
 		 803 aa  709    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5562  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  69.21 
 
 		 800 aa  1092    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3089  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  60.85 
 
 		 800 aa  983    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.17686  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1469  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  42.7 
 
 		 818 aa  633  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2415  Pyrrolo-quinoline quinone  41.17 
 
 		 811 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00299347  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1963  quinate dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone)  42.08 
 
 		 794 aa  602  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4849  Pyrrolo-quinoline quinone  41.71 
 
 		 803 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.97652  hitchhiker  0.0000763384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2574  quinoprotein  40.02 
 
 		 791 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3111  quinoprotein glucose dehydrogenase  41.18 
 
 		 752 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2568  glucose dehydrogenase  40.34 
 
 		 788 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2205  Pyrrolo-quinoline quinone  39.92 
 
 		 805 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2352  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  40.18 
 
 		 805 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2712  Pyrrolo-quinoline quinone  39.97 
 
 		 801 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142999  normal  0.96435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3825  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  40.66 
 
 		 800 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5965  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  39.25 
 
 		 798 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.558391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2577  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  39.38 
 
 		 840 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.263585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3569  quinate dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone), putative  39.49 
 
 		 805 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2112  Pyrrolo-quinoline quinone  38.01 
 
 		 814 aa  560  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2956  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  39.82 
 
 		 805 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0315407  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2024  quinoprotein glucose dehydrogenase  39.7 
 
 		 784 aa  552  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.963256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2746  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  37.72 
 
 		 809 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113463  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2294  PQQ dehydrogenase family protein  39.22 
 
 		 769 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3211  Pyrrolo-quinoline quinone  37.79 
 
 		 837 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2831  quinoprotein glucose dehydrogenase  38.41 
 
 		 828 aa  538  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.871062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1961  Pyrrolo-quinoline quinone  37.86 
 
 		 783 aa  534  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1527  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  40.63 
 
 		 809 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2382  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  37.52 
 
 		 807 aa  532  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5248  pyrroloquinoline-quinone-dependent quinate dehydrogenase  38.36 
 
 		 809 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3417  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  40.12 
 
 		 772 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3055  Pyrrolo-quinoline quinone  41.76 
 
 		 853 aa  521  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000520854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3339  GntR domain-containing protein  41 
 
 		 854 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466737  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3145  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  38.76 
 
 		 772 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3539  quinoprotein glucose dehydrogenase  40.78 
 
 		 724 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2593  quinoprotein glucose dehydrogenase  39.81 
 
 		 639 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238471  normal  0.0735284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1054  quinoprotein glucose dehydrogenase  40.37 
 
 		 669 aa  456  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2610  Pyrrolo-quinoline quinone  37.02 
 
 		 676 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.453201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0170  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.88 
 
 		 680 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.810213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  30.56 
 
 		 704 aa  270  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  29.45 
 
 		 698 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1594  glucose dehydrogenase  29.73 
 
 		 651 aa  239  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5932  quinate/shikimate dehydrogenase, putative  28.57 
 
 		 671 aa  237  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1611  Glycerol dehydrogenase (acceptor)  32.35 
 
 		 722 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.21 
 
 		 731 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  33.48 
 
 		 720 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  31.06 
 
 		 701 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1014  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.01 
 
 		 732 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101534  normal  0.630139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0311  Pyrrolo-quinoline quinone  32.63 
 
 		 705 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.394174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.48 
 
 		 747 aa  201  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  32.37 
 
 		 718 aa  198  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  24.69 
 
 		 614 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  23.85 
 
 		 573 aa  189  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.45 
 
 		 769 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  26.26 
 
 		 568 aa  177  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  23.77 
 
 		 577 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  23.27 
 
 		 576 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>