248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2415 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3569  quinate dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone), putative  66.62 
 
 
805 aa  1077    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2568  glucose dehydrogenase  52.83 
 
 
788 aa  795    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5248  pyrroloquinoline-quinone-dependent quinate dehydrogenase  68.26 
 
 
809 aa  1122    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2712  Pyrrolo-quinoline quinone  66.92 
 
 
801 aa  1071    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142999  normal  0.96435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2746  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  63.28 
 
 
809 aa  1046    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2956  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  66.12 
 
 
805 aa  1072    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0315407  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2415  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
811 aa  1654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00299347  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2352  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  67.18 
 
 
805 aa  1083    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140873  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2205  Pyrrolo-quinoline quinone  66.88 
 
 
805 aa  1093    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596534  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1963  quinate dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone)  53.49 
 
 
794 aa  848    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3417  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  43.93 
 
 
772 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3145  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  43.32 
 
 
772 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2294  PQQ dehydrogenase family protein  42.32 
 
 
769 aa  624  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4849  Pyrrolo-quinoline quinone  39.64 
 
 
803 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.97652  hitchhiker  0.0000763384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00123  glucose dehydrogenase  40.99 
 
 
796 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3478  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  40.99 
 
 
796 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0126  glucose dehydrogenase  40.99 
 
 
796 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3535  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  40.99 
 
 
796 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0132  quinoprotein glucose dehydrogenase  40.99 
 
 
796 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.556262  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0128  glucose dehydrogenase  40.99 
 
 
796 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00122  hypothetical protein  40.99 
 
 
796 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.793225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0134  quinoprotein glucose dehydrogenase  40.99 
 
 
796 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0672  quinoprotein glucose dehydrogenase  40.1 
 
 
796 aa  578  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.570981  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3089  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  40.79 
 
 
800 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.17686  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1505  quinoprotein glucose dehydrogenase  40.07 
 
 
809 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.900806  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2024  quinoprotein glucose dehydrogenase  40.52 
 
 
784 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.963256  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0173  quinoprotein glucose dehydrogenase  40.62 
 
 
799 aa  572  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3930  quinoprotein  38.91 
 
 
807 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000484282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0188  quinoprotein glucose dehydrogenase  39.61 
 
 
796 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.683326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0791  quinoprotein glucose dehydrogenase  40.72 
 
 
806 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3100  quinoprotein glucose dehydrogenase  40.28 
 
 
791 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5562  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  39.58 
 
 
800 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2951  glucose dehydrogenase  39.67 
 
 
803 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.734246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1444  glucose dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone)  38.32 
 
 
803 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244266  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4361  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  38.45 
 
 
803 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691425  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1961  Pyrrolo-quinoline quinone  39.21 
 
 
783 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567557  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34970  glucose dehydrogenase  39.54 
 
 
803 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00222942  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4577  quinoprotein glucose dehydrogenase  38.5 
 
 
803 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4277  Pyrrolo-quinoline quinone  38.07 
 
 
803 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0184  quinoprotein glucose dehydrogenase  39.58 
 
 
747 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.23859  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0193  quinoprotein glucose dehydrogenase  39.58 
 
 
747 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52734  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1081  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  39.09 
 
 
803 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0185  quinoprotein glucose dehydrogenase  39.58 
 
 
747 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.266992  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7581  quinoprotein glucose dehydrogenase  39.7 
 
 
799 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2843  glucose dehydrogenase  39.49 
 
 
777 aa  531  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0992  Pyrrolo-quinoline quinone  38.1 
 
 
779 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00168374  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3825  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  37.32 
 
 
800 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0201  quinoprotein glucose dehydrogenase  39.71 
 
 
747 aa  532  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1469  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  36.49 
 
 
818 aa  524  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128704  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4196  glucose dehydrogenase  39.6 
 
 
747 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1237  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.57 
 
 
844 aa  520  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40050  Quinoprotein glucose dehydrogenase  39.49 
 
 
801 aa  522  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0595  quinoprotein glucose dehydrogenase  37.9 
 
 
776 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3086  glucose dehydrogenase  36.77 
 
 
775 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596873  normal  0.134716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2577  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  37.48 
 
 
840 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.263585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3211  Pyrrolo-quinoline quinone  37.34 
 
 
837 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156633  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0980  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  36.68 
 
 
779 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.804184  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0411  quinoprotein glucose dehydrogenase  37.02 
 
 
856 aa  512  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0294  Pyrrolo-quinoline quinone  37.38 
 
 
776 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3525  quinoprotein glucose dehydrogenase  35.62 
 
 
852 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2382  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  36.13 
 
 
807 aa  512  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220002  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5020  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  38.78 
 
 
812 aa  502  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0342  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  37.27 
 
 
868 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0856  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  36.69 
 
 
779 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337612  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5965  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  37.48 
 
 
798 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.558391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3055  Pyrrolo-quinoline quinone  36.98 
 
 
853 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000520854  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2112  Pyrrolo-quinoline quinone  35.71 
 
 
814 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2574  quinoprotein  36.21 
 
 
791 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2673  quinoprotein glucose dehydrogenase  35.51 
 
 
781 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1211  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.26 
 
 
777 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471268  normal  0.152671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1330  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.35 
 
 
781 aa  475  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3111  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.19 
 
 
752 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2831  quinoprotein glucose dehydrogenase  35.61 
 
 
828 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.871062  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1775  Pyrrolo-quinoline quinone  37.92 
 
 
854 aa  466  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3339  GntR domain-containing protein  39.48 
 
 
854 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466737  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1682  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  44.81 
 
 
837 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404284  normal  0.183517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1527  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  36.01 
 
 
809 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2593  quinoprotein glucose dehydrogenase  38.15 
 
 
639 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238471  normal  0.0735284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2610  Pyrrolo-quinoline quinone  36.6 
 
 
676 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.453201 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3539  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.75 
 
 
724 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331402  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1054  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.67 
 
 
669 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0170  quinoprotein glucose dehydrogenase  31.99 
 
 
680 aa  320  9e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.810213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  29.28 
 
 
704 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1594  glucose dehydrogenase  29.88 
 
 
651 aa  229  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5932  quinate/shikimate dehydrogenase, putative  28.26 
 
 
671 aa  225  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  31.98 
 
 
718 aa  216  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1611  Glycerol dehydrogenase (acceptor)  30.66 
 
 
722 aa  210  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  31.15 
 
 
720 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  30.1 
 
 
698 aa  202  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1014  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.29 
 
 
732 aa  200  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101534  normal  0.630139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.39 
 
 
731 aa  194  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.36 
 
 
747 aa  193  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0311  Pyrrolo-quinoline quinone  30.86 
 
 
705 aa  190  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.394174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  29.49 
 
 
701 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.04 
 
 
769 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  26.76 
 
 
577 aa  164  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 
561 aa  153  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  26.65 
 
 
562 aa  151  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  25.62 
 
 
576 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  25.51 
 
 
570 aa  147  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>