68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0018 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  100 
 
 		 138 aa  281  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  47.67 
 
 		 283 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  46.51 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  35.82 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  25.66 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  32.61 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  53.49 
 
 		 476 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  40.98 
 
 		 129 aa  47.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  40.98 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  40 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3018  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223373  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  42.37 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  40.68 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2451  cytochrome c  31.36 
 
 		 558 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.131224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  40.68 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  51.22 
 
 		 329 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  40.68 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  40.68 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  32.22 
 
 		 153 aa  43.9  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  34.69 
 
 		 440 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  61.29 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  41.67 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4193  cytochrome c-550  31.07 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000176262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0593  hypothetical protein  35.24 
 
 		 292 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  68 
 
 		 381 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4514  cytochrome c-550  31.07 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000708555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3128  cytochrome c class I  39.34 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 274 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4148  cytochrome c class I  65.38 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.967829  normal  0.37393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2675  cytochrome c-type protein  39.34 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  38.33 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4313  cytochrome c-550  31.07 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74805e-54 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1958  hypothetical protein  37.7 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.054097  normal  0.381624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4630  cytochrome c class I  65.38 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.881109 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2460  cytochrome c  30.51 
 
 		 508 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.360393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  47.83 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3088  cytochrome c, class I  39.34 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  34.94 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  34.94 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  60 
 
 		 192 aa  42  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4516  cytochrome c class I  65.38 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0581555  normal  0.874562 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 120 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4408  cytochrome c-550  33.78 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4425  cytochrome c-550  33.78 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000170237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0828  cytochrome c-550  33.78 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000131619  hitchhiker  6.35976e-19 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  34.94 
 
 		 452 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4371  cytochrome c-550  33.78 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4143  cytochrome c class I  30.1 
 
 		 118 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000375642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4031  cytochrome c-550  30.1 
 
 		 118 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040592  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  34.94 
 
 		 452 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  34.94 
 
 		 452 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4041  cytochrome c-550  30.1 
 
 		 118 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000123285  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  35 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  34.94 
 
 		 452 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  34.94 
 
 		 497 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  34.15 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  41.51 
 
 		 678 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4208  cytochrome c class I  43.59 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0400385  normal  0.12753 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  37.29 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  39.44 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  36.07 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3486  cytochrome c, putative  30.43 
 
 		 559 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0158874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2430  cytochrome c, class I  32.63 
 
 		 301 aa  40  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  64 
 
 		 778 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1065  hypothetical protein  35.53 
 
 		 416 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145619  normal  0.0411422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>