90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_11331 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  52.07 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  59.63 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  57.8 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  58.59 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  58.59 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  51.38 
 
 		 125 aa  126  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  57.58 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  56.82 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  44.66 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  48.21 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  48.21 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  44.74 
 
 		 124 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  51.09 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  44.25 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  41.28 
 
 		 109 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  47.62 
 
 		 87 aa  83.6  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3018  cytochrome c class I  29.47 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 293 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  36.47 
 
 		 283 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  26.51 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  27.71 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4031  cytochrome c-550  29.47 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4313  cytochrome c-550  29.47 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74805e-54 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  42.37 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  33 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4041  cytochrome c-550  29.47 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000123285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4193  cytochrome c-550  29.47 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000176262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4514  cytochrome c-550  29.47 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000708555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  33.33 
 
 		 290 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2575  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.15 
 
 		 307 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  27.38 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4143  cytochrome c class I  28.42 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000375642  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  22.89 
 
 		 111 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  30 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  27.5 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  36.92 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4408  cytochrome c-550  28.42 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4425  cytochrome c-550  28.42 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000170237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0828  cytochrome c-550  28.42 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000131619  hitchhiker  6.35976e-19 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  27.59 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4371  cytochrome c-550  28.42 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  29.63 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.49 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  30 
 
 		 270 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  30.86 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  25 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  33.71 
 
 		 287 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  26.17 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 381 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  30.99 
 
 		 557 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  24.1 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  23.75 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  22.52 
 
 		 263 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  29.07 
 
 		 111 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  32.05 
 
 		 259 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 330 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  25 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  28.83 
 
 		 276 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  24.24 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  26.72 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  32.53 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2486  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 266 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.148102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.86 
 
 		 293 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  30.23 
 
 		 704 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  32.95 
 
 		 352 aa  40.8  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.58 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.19 
 
 		 1040 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38850  cytochrome c550  27.37 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4492  cytochrome c, class I  25.58 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  29 
 
 		 284 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  32.18 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  25 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3311  cytochrome c550  27.37 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0466  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.58 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00151581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  24.55 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  32.95 
 
 		 352 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5233  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.53 
 
 		 293 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2114  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.53 
 
 		 293 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  27.17 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  29.13 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  30.12 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  32.1 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.21 
 
 		 312 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.53 
 
 		 1191 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.92 
 
 		 308 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  29.55 
 
 		 275 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>