43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4020 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  100 
 
 		 124 aa  253  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  75.81 
 
 		 124 aa  201  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  59.68 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  59.68 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  54.84 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  59.26 
 
 		 109 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  56.48 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  60.47 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  49.55 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  54.12 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  51.76 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  42.24 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  41.38 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  44.25 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  40.7 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  40.7 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  39.58 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  37.1 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  35.63 
 
 		 283 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  26.76 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 444 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0781  cytochrome c family protein  30.26 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  33.33 
 
 		 439 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  36.71 
 
 		 268 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  32.88 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32 
 
 		 415 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  38.16 
 
 		 647 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  31.46 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  45.31 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  33 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  44.68 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  32 
 
 		 439 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2042  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  30.14 
 
 		 546 aa  40.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1936  cytochrome c class I  27.13 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0891775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.68 
 
 		 439 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 400 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  32.56 
 
 		 433 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.62 
 
 		 1040 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>