36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2140 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  100 
 
 		 87 aa  177  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  63.22 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  63.22 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  63.95 
 
 		 124 aa  121  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  60.47 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  57.47 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  52.33 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  50.57 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  50.59 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  48.24 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  45.88 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  45.88 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  45.88 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  47.62 
 
 		 130 aa  83.6  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  40.7 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  39.53 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  39.53 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  30.69 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  35.48 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  38.98 
 
 		 444 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 330 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  26.37 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  33.77 
 
 		 251 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  26.32 
 
 		 556 aa  41.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2363  cytochrome c class I  25 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.217557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4492  cytochrome c, class I  29.55 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  30.12 
 
 		 342 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2631  cytochrome c class I  27.88 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2484  cytochrome c, class I  26 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.789721  normal  0.114266 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  32.47 
 
 		 382 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 		 382 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  32.91 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 270 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 		 394 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1498  cytochrome c, class I  27.03 
 
 		 146 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>