46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2147 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  100 
 
 
124 aa  255  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  100 
 
 
124 aa  255  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  60.48 
 
 
124 aa  154  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  58.06 
 
 
124 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  59.68 
 
 
124 aa  144  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  63.22 
 
 
87 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  53.1 
 
 
145 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  52.78 
 
 
109 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  47.9 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  49.09 
 
 
129 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  45.45 
 
 
129 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  48.21 
 
 
130 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  45.22 
 
 
137 aa  100  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  49.46 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  44.94 
 
 
100 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  46.51 
 
 
128 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  44.94 
 
 
100 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40 
 
 
1023 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  29.67 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  32.04 
 
 
283 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  35.29 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  25.41 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  30 
 
 
284 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  35.44 
 
 
268 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 
330 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  36.59 
 
 
256 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  31.03 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  27.52 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  28.57 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  23.77 
 
 
153 aa  42  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  27.43 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  28.7 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  33.33 
 
 
153 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  31.11 
 
 
259 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  30.63 
 
 
120 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  27.12 
 
 
111 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  30 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  28.7 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  30.68 
 
 
561 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  42.86 
 
 
111 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3018  cytochrome c class I  31.19 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  31.51 
 
 
286 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  29.03 
 
 
280 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  27.38 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  30.95 
 
 
381 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  35.09 
 
 
519 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>