33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5747 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  216  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  61.32 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  63.81 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  68.97 
 
 		 94 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  62.86 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  54.9 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  50.96 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  54.46 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  62.03 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  52.58 
 
 		 111 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  52.94 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  53.47 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  51.96 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  55.06 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  51.96 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  60.26 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  48.1 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  55.84 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  52.56 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  49.5 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  47.83 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  58.7 
 
 		 54 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  37.08 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  34.09 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  28.04 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2628  cytochrome c, putative  36.67 
 
 		 551 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  32.14 
 
 		 123 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  35.37 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 284 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  32.14 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  29.11 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  29.11 
 
 		 100 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>