23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1579 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  253  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  47.52 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  51.81 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  50.56 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  44.16 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  37.5 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  36.46 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  37.5 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  36.54 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  34.38 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  38.67 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  38.89 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  36.05 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  32.08 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  31.19 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  31 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  30.77 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  32.05 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0679  putative cytochrome c  36.08 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  31.63 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 112 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>