26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0438 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  100 
 
 
124 aa  250  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  85.48 
 
 
124 aa  201  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  50.56 
 
 
127 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  48 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  48 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  42.11 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  43.18 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  46.05 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  40.26 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  32.61 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  34.31 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  31.46 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  29.63 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  31.46 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  34.04 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  35.9 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  30.26 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  33.33 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  33.63 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  29.27 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  30.93 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  30.67 
 
 
104 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  32.22 
 
 
105 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  32.04 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  32.08 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  29.11 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>