36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4714 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  100 
 
 		 105 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  73.08 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  77.66 
 
 		 94 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  69.23 
 
 		 104 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  63.81 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  59.18 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  57.69 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  58.16 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  52.38 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  58.16 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  58.16 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  65 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  65 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  58.14 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  52.04 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  50.5 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  48.35 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  48.08 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  46.53 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  48.57 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  50 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  54.35 
 
 		 54 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  37.04 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  31.17 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  29.9 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  32.38 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  29.63 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  32.22 
 
 		 124 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2466  cytochrome c class I  34.82 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  27.36 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  29.63 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  30.56 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>