29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1356 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  100 
 
 		 94 aa  196  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  79.79 
 
 		 104 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  77.66 
 
 		 105 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  69.89 
 
 		 104 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  68.97 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  58.06 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  65.82 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  56.99 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  57.3 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  62.03 
 
 		 111 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  52.13 
 
 		 111 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  61.54 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  60.76 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  60.26 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  53.06 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  55.17 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  54.55 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  47.31 
 
 		 119 aa  84.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  53.03 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  47.44 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  43.59 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  62.79 
 
 		 54 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  35.8 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  34.09 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  29.21 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  29.87 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  30.86 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  28.74 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  30.26 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>