25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0509 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  240  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  48.51 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  43.64 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  46.53 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  49.5 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  52.44 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  45.19 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  47.31 
 
 		 94 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  50 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  47.42 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  46.9 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  46.39 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  48.78 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  42.34 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  48.68 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  40.57 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  54.39 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  43.42 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  36.96 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  51.11 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2466  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>