41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2462 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  100 
 
 		 134 aa  263  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  45.28 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  41.96 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  33.61 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  40.22 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  39.52 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  38.04 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  38.71 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  35.09 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  37.36 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  34.09 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  33.9 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  33.6 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  34.09 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  35.63 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  32.95 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  33 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  36.78 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  32.73 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  30.53 
 
 		 349 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  30.53 
 
 		 349 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 444 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 337 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 349 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 349 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  31.87 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4084  PT repeat-containing protein  26.47 
 
 		 202 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000901223  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2466  cytochrome c class I  33.67 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  30.53 
 
 		 349 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  29.03 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  32.48 
 
 		 337 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  33.87 
 
 		 388 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>