36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1945 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  231  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  58.23 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  62.03 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  56.96 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  58.23 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  56.96 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  41.77 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  36.59 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  34.38 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0679  putative cytochrome c  40.24 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  36.25 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  34.69 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  31.87 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  33.77 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  30.49 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  28.04 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2466  cytochrome c class I  35.65 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  29 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  33.77 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  31.17 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  33.33 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  32.1 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  32 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  36.62 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  29.87 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  28.09 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  31.71 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  31.65 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  32.47 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  26.85 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  25.93 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>