20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2428 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  100 
 
 		 104 aa  214  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  73.53 
 
 		 104 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  66.02 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  67.31 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  56.96 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  53.95 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  35.58 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0679  putative cytochrome c  38.54 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  34.29 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  31.76 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  29.41 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  30.1 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  29.59 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  27.63 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  30.26 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  27.55 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>