29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1273 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  100 
 
 		 115 aa  235  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  44.66 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  37.82 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  37.5 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  46.15 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  36.46 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  38.54 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  35.35 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  42.11 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  41.05 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  39.58 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  34.69 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  35.9 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  31.73 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  32.99 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  37.18 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  29.46 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0679  putative cytochrome c  41.03 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  29.13 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  30.58 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  32.58 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  28.75 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 110 aa  42  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  32.05 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  27.36 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>