21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0849 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  100 
 
 		 114 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  63.16 
 
 		 115 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  65.79 
 
 		 115 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  54.46 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  40.54 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  35.35 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  40 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  43.18 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  35.53 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  35.53 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  27.68 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  29 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  31.17 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0679  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  31.65 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  30 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  25.89 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  34.94 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  28.18 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  30.77 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>