51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1301 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  83.96 
 
 		 111 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  83.02 
 
 		 108 aa  169  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  70.79 
 
 		 111 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  73.86 
 
 		 110 aa  140  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  57.02 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  67.86 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  53.72 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  65.06 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  52.34 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  65 
 
 		 105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  57.3 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  51.96 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  55.21 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  54.88 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  59.74 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  54.43 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  51.9 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  51.19 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  42.06 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  39.77 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  44.32 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  51.16 
 
 		 54 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  32.99 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  29.89 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  34.83 
 
 		 124 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  29.89 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  32.23 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  32.61 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  28.74 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  31.67 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  34.04 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  30.86 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  27.59 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  27.73 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  30.16 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  37.35 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  29.79 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  30.49 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  27.16 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  32.38 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2466  cytochrome c class I  37.66 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  32.94 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  38.27 
 
 		 268 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>