25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4040 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  209  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  69.23 
 
 		 105 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  64.42 
 
 		 104 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  69.89 
 
 		 94 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  62.86 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  47.22 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  48.6 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  43.14 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  47.66 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  54.43 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  47.12 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  50.59 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  44.12 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  54.43 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  50 
 
 		 112 aa  87  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  51.95 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  43.16 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  54.55 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  38.46 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  54.35 
 
 		 54 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  32.95 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  30.86 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  25.93 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>