29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2237 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  100 
 
 		 109 aa  223  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  49.02 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  44.66 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  48.11 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  50.59 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  50 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  48.72 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  50 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  47.17 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  46 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  46.53 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  41.44 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  44.23 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  47.44 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  50.65 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  44.05 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  39.81 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  44.87 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  39.08 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  40.86 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  46.51 
 
 		 54 aa  52  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  29.81 
 
 		 111 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2466  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  30.28 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  28.44 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>