47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2618 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  100 
 
 		 110 aa  223  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  75.68 
 
 		 111 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  70 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  73.86 
 
 		 121 aa  140  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  69 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  60.75 
 
 		 112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  59.63 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  70.24 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  54.81 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  57.69 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  58.06 
 
 		 94 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  66.27 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  52.73 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  50.96 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  60.49 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  47.12 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  53.57 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  50.54 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  58.44 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  52.44 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  48.31 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  43.33 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  63.04 
 
 		 54 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  40.91 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  32.46 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  33.33 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  29.82 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  27.71 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  28.57 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  31.25 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  29.11 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  31.71 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  32.53 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  29.11 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 289 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  29.46 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  30.91 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  32.11 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  32.93 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  30 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  30 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  25.93 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 305 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3841  cytochrome c variant  28.57 
 
 		 230 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>