99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1478 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  100 
 
 		 145 aa  296  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  59.26 
 
 		 124 aa  134  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  56.48 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  53.1 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  53.1 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  53.27 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  57.61 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  50.48 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  55.29 
 
 		 129 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  47.66 
 
 		 137 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  44.66 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  45.45 
 
 		 100 aa  103  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  44.44 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  50.59 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  52.33 
 
 		 87 aa  98.6  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  37.4 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  37.3 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 308 aa  50.8  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.18 
 
 		 312 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  33.77 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5018  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.41 
 
 		 287 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0848  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  30.25 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  37.8 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4959  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.84 
 
 		 287 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.71 
 
 		 367 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.63 
 
 		 298 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  25.38 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  34.78 
 
 		 704 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  28.32 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.05 
 
 		 308 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  44.74 
 
 		 381 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  31.67 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3776  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  33.05 
 
 		 308 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  30.19 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  29.13 
 
 		 314 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  35.63 
 
 		 283 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  31.4 
 
 		 352 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  29.55 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  32.18 
 
 		 353 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  34.25 
 
 		 152 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  44.74 
 
 		 346 aa  42.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  34.94 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  33.71 
 
 		 372 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.35 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  32 
 
 		 153 aa  42  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  29.73 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4492  cytochrome c, class I  32.5 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 		 352 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  34.09 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0905  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  37.5 
 
 		 287 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  33.71 
 
 		 372 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  32.18 
 
 		 354 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1615  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  65.22 
 
 		 313 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  0.0271548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  44.68 
 
 		 111 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  30.23 
 
 		 263 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  36.36 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  65.22 
 
 		 325 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3724  cytochrome c-551  28.05 
 
 		 112 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1610  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  65.22 
 
 		 325 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00269268  hitchhiker  0.0066634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  33.02 
 
 		 671 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  32.18 
 
 		 434 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  33.71 
 
 		 381 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 330 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  31.78 
 
 		 370 aa  40.8  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  44.19 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  33.01 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  30.09 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  45.24 
 
 		 296 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  35.59 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0462  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.76 
 
 		 294 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528353  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  30.14 
 
 		 163 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 259 aa  40.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 349 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  32.39 
 
 		 286 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  34.94 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 349 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5348  cytochrome c-551  28.24 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  27.74 
 
 		 329 aa  40  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.3 
 
 		 1023 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5291  cytochrome c-551  28.24 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  44.74 
 
 		 355 aa  40  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4360  cytochrome c, class I  40.62 
 
 		 235 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 272 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 272 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 272 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.1 
 
 		 296 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  40.3 
 
 		 432 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 101 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  40.3 
 
 		 432 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  40.3 
 
 		 432 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  40.3 
 
 		 432 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  40.3 
 
 		 432 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  40.3 
 
 		 432 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  40.3 
 
 		 432 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>