122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2773 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  310  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  64.24 
 
 		 151 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  30.88 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  31.03 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  31.58 
 
 		 207 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  29.41 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  31.51 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  31.37 
 
 		 388 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  29.92 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  33.71 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  30.93 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  27.21 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  37.8 
 
 		 632 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  30.82 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  30.82 
 
 		 190 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  37.8 
 
 		 647 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  36.59 
 
 		 636 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  36.59 
 
 		 647 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  30.3 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  28.45 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  38.75 
 
 		 632 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  28.18 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  26.83 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  22.91 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  27.66 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  29.07 
 
 		 194 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  26.49 
 
 		 175 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  38.3 
 
 		 649 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  26.24 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  26.76 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  27.82 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  36.36 
 
 		 633 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  38.3 
 
 		 642 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  38.3 
 
 		 642 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  38.82 
 
 		 642 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  32.2 
 
 		 629 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  30 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  22.78 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  25.68 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  36.14 
 
 		 631 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  37.23 
 
 		 640 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  35.06 
 
 		 652 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  31 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  36.47 
 
 		 644 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  30 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  27.38 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  37.35 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  34.88 
 
 		 254 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  36.17 
 
 		 640 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  31.93 
 
 		 296 aa  50.8  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 702 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 702 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  29.17 
 
 		 185 aa  50.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  26.8 
 
 		 393 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  29.17 
 
 		 388 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  29.17 
 
 		 388 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  28.09 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  27.96 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  29.46 
 
 		 268 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1219  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  32 
 
 		 343 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.983776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  26.8 
 
 		 393 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  26.8 
 
 		 394 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  26.8 
 
 		 394 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  25.77 
 
 		 394 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 546 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 395 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  25 
 
 		 382 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  29.79 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  25.77 
 
 		 394 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  32.98 
 
 		 643 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  34.02 
 
 		 314 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  27.84 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  27.84 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  32.26 
 
 		 286 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  33.02 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  28.93 
 
 		 256 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 295 aa  43.9  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  26.61 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  46.51 
 
 		 647 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  28.57 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  31.87 
 
 		 284 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  26.25 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  27.91 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  44.12 
 
 		 571 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  36.47 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  30.49 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  45.45 
 
 		 652 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  31.48 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  28.87 
 
 		 339 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  23.76 
 
 		 165 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>