86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2561 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  100 
 
 		 131 aa  271  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  60.36 
 
 		 111 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  60.36 
 
 		 111 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  59.46 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  58.18 
 
 		 110 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  52.25 
 
 		 111 aa  125  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  47.75 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  54.95 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  54.95 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  56.32 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  55.68 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  49.14 
 
 		 115 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  48.91 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  40.18 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  43.56 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  37.27 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  38.32 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  42.39 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  36.67 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  38.14 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  38.14 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  36.27 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  36.17 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  31.36 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  29.36 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  36.05 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  36.14 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  35.23 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  31.78 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  28.7 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  28.57 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0462  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.82 
 
 		 294 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528353  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  31.78 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1877  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.68 
 
 		 325 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.020094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.48 
 
 		 726 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  34.67 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  32.67 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.9 
 
 		 311 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  26.79 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.38 
 
 		 293 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  32.29 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  36.25 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  31.51 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  29.55 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.48 
 
 		 293 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5018  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.14 
 
 		 287 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.46 
 
 		 293 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  32.86 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  40.26 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  30.26 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.95 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.84 
 
 		 296 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 320 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4959  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.52 
 
 		 287 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.51 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.09 
 
 		 289 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.09 
 
 		 289 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  32.29 
 
 		 313 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  28.57 
 
 		 525 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0466  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.46 
 
 		 287 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00151581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  29.67 
 
 		 290 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 97 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 189 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  30 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0341  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  29.59 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0261936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  29.49 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  29.46 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  40.54 
 
 		 307 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  31.52 
 
 		 727 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2114  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.13 
 
 		 293 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5233  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.13 
 
 		 293 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1529  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.12 
 
 		 296 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  25 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  36.47 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.46 
 
 		 312 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0342  putative cytochrome c55X precursor  29.27 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  32.05 
 
 		 112 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  34.25 
 
 		 97 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.11 
 
 		 575 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>