71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0435 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  39.37 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  37.04 
 
 		 687 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2859  hypothetical protein  33.47 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  34.91 
 
 		 683 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  34.6 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 571 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  31.71 
 
 		 647 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  24.78 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  33.02 
 
 		 123 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  31.71 
 
 		 647 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  32.32 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  30 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  31.71 
 
 		 636 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  31.37 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  35.64 
 
 		 652 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  37.04 
 
 		 644 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  36.54 
 
 		 664 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  28.93 
 
 		 190 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2649  cytochrome c, class IC  36.36 
 
 		 118 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  26.97 
 
 		 629 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  36.89 
 
 		 643 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  27.46 
 
 		 393 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  33.65 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  26.14 
 
 		 640 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  27.46 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  27.59 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3282  cytochrome c, class IC  39.02 
 
 		 118 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243795  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  27.59 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  26.95 
 
 		 394 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  27.27 
 
 		 190 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  27.83 
 
 		 631 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  27.27 
 
 		 190 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  26.21 
 
 		 394 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  28.7 
 
 		 652 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  32.08 
 
 		 254 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  25.57 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  32.17 
 
 		 645 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  26.83 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  29.6 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  25.57 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  26.83 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  34.88 
 
 		 632 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  33.71 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  34.02 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.63 
 
 		 653 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  27.84 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  30.77 
 
 		 647 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  32.38 
 
 		 702 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  32.38 
 
 		 702 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  28.23 
 
 		 642 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  36.17 
 
 		 649 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  25.13 
 
 		 657 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  29.13 
 
 		 145 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  36.56 
 
 		 653 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  27.42 
 
 		 642 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  29.41 
 
 		 683 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  27.42 
 
 		 642 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  24.83 
 
 		 393 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  32.26 
 
 		 632 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.77 
 
 		 637 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  30.61 
 
 		 137 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  24.84 
 
 		 652 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6691  hypothetical protein  29.29 
 
 		 171 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 220 aa  42.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  25.83 
 
 		 155 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  33.68 
 
 		 129 aa  42.7  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0775  class I monoheme cytochrome c  48.57 
 
 		 139 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  27.42 
 
 		 640 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  27.27 
 
 		 212 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>