232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1045 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  100 
 
 		 98 aa  199  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  46.48 
 
 		 698 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  42.86 
 
 		 731 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  41.43 
 
 		 720 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  43.59 
 
 		 312 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  37.68 
 
 		 701 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0716  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  42.25 
 
 		 299 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000848569  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 251 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.29 
 
 		 769 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  40.58 
 
 		 704 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  44.3 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  37.68 
 
 		 718 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1611  Glycerol dehydrogenase (acceptor)  38.24 
 
 		 722 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0311  Pyrrolo-quinoline quinone  35.96 
 
 		 705 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.394174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  38.67 
 
 		 747 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.24 
 
 		 313 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3819  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.97 
 
 		 313 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  35.11 
 
 		 433 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  35.42 
 
 		 439 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  36.19 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  35.42 
 
 		 439 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  35 
 
 		 274 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  42.47 
 
 		 513 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  35.78 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1610  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.24 
 
 		 325 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00269268  hitchhiker  0.0066634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.97 
 
 		 313 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 377 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 377 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.24 
 
 		 325 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  40.26 
 
 		 285 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  39.08 
 
 		 278 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  39.08 
 
 		 278 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  32.95 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1615  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.97 
 
 		 313 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  0.0271548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4258  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.24 
 
 		 325 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.816603 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  39.44 
 
 		 405 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  36.08 
 
 		 278 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 278 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 278 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3576  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.89 
 
 		 326 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1526  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.08 
 
 		 311 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  43.66 
 
 		 503 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  36.71 
 
 		 327 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  37.97 
 
 		 380 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1014  Quinoprotein glucose dehydrogenase  35.14 
 
 		 732 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101534  normal  0.630139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  32.65 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3416  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  40.51 
 
 		 325 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 280 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2001  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.24 
 
 		 325 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  32.94 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2821  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.33 
 
 		 303 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2038  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  39.24 
 
 		 304 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645844  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  31.3 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0341  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  40.26 
 
 		 306 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0261936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  32.93 
 
 		 432 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  38.55 
 
 		 283 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  37.89 
 
 		 418 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  39.73 
 
 		 356 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2013  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.17 
 
 		 324 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00187341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.93 
 
 		 432 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  32.98 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  35.16 
 
 		 307 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  36.76 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  36.59 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1848  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.33 
 
 		 318 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149886  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  36 
 
 		 511 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  30.53 
 
 		 499 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  30.53 
 
 		 499 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  31.88 
 
 		 291 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.32 
 
 		 439 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1491  cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  27.71 
 
 		 217 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  46.3 
 
 		 308 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  32.94 
 
 		 432 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 202 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  35.23 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 313 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  34.29 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.95 
 
 		 432 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  36.62 
 
 		 387 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2607  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.17 
 
 		 332 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00078494  normal  0.780558 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  38.03 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 		 351 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 305 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  35.48 
 
 		 519 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 561 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.53 
 
 		 415 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  38.36 
 
 		 521 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  38.46 
 
 		 324 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  31.76 
 
 		 432 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  38.57 
 
 		 525 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  34.25 
 
 		 382 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  38.57 
 
 		 525 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  31.76 
 
 		 432 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  31.76 
 
 		 432 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  37.97 
 
 		 304 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  31.76 
 
 		 432 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>