31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4390 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  221  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3062  hypothetical protein  47.71 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1211  hypothetical protein  46.79 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2408  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3836  putative p-cresol methylhydroxylase subunit  39.71 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1477  cytochrome c, class I  33.02 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1842  hypothetical protein  35.53 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.587463  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2961  cytochrome c, class I  40.32 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  36.84 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  36.25 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  37.35 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  38.27 
 
 		 277 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2123  hypothetical protein  34.29 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  39.19 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3478  hypothetical protein  33.82 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  37.04 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  33.33 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 329 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1651  hypothetical protein  32.47 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1491  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 109 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  34.78 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  39.33 
 
 		 280 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  32.94 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 111 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 111 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 683 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>