51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0879 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  100 
 
 
111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  56.48 
 
 
111 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  60.71 
 
 
113 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  60.71 
 
 
113 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  52.38 
 
 
111 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  47.17 
 
 
104 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  47.27 
 
 
115 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  49.45 
 
 
112 aa  97.1  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  40 
 
 
111 aa  89.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  42.99 
 
 
111 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  39.09 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  42.73 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  43.3 
 
 
121 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  47.13 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  41.76 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  38.32 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  39.6 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  46.43 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  46.15 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  39.42 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  39.42 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  45.24 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  38.04 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  40.43 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  43.53 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  33.33 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  35.09 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  35.87 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  29.63 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  33.78 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  26.13 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  30.95 
 
 
154 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  31.08 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  36.49 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  29.91 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  34.25 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  32.26 
 
 
738 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  32.88 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  34.78 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  28.95 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  32.58 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  32.81 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.1 
 
 
723 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  34.67 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  26.32 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  28.95 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  30.38 
 
 
718 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  36.84 
 
 
285 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37509  predicted protein  32.99 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0501063  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  32.94 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.828991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>