81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2038 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  100 
 
 
111 aa  224  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  100 
 
 
111 aa  224  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  60.36 
 
 
131 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  60 
 
 
110 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  56.76 
 
 
111 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  55.86 
 
 
111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  56.76 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  42.34 
 
 
111 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  52.25 
 
 
111 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  48.28 
 
 
115 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  55.68 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  51.14 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  42.72 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  41.94 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  38.39 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  39.58 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  39.58 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  40.38 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  39.42 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  35.9 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  37.27 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  38.46 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  30.56 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  36.28 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  28.44 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  34.52 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  37.33 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  35.44 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  39.24 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  29.63 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  35.62 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  27.52 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  28.75 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  32.99 
 
 
284 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  30.95 
 
 
125 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  33.33 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  31.78 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  35.9 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  40.23 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  40 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  32.05 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1877  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.25 
 
 
325 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.020094  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_9790  distinct from photosynthetic electron transfer catalyst, CYC6  38.1 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260677  normal  0.0456751 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0341  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  35.29 
 
 
306 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0261936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  36.54 
 
 
525 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  29.47 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.52 
 
 
289 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.52 
 
 
289 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3863  cytochrome c-550  31.46 
 
 
165 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.847125  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  30.61 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  31.33 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 
311 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  37.5 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1826  cytochrome c, class I  31.51 
 
 
251 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.384457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.71 
 
 
575 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  38.46 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44400  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.65 
 
 
318 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  37.5 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  30.43 
 
 
286 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  29.47 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0466  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.61 
 
 
287 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00151581  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3780  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  31.65 
 
 
318 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  28.92 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0342  putative cytochrome c55X precursor  29.41 
 
 
114 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  35.53 
 
 
131 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  30 
 
 
112 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  34.12 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.71 
 
 
293 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  36.11 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  32.61 
 
 
287 aa  41.2  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5245  cytochrome c class I  28.26 
 
 
197 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.330524  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.97 
 
 
287 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  44.74 
 
 
511 aa  40.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.04 
 
 
296 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  26.96 
 
 
278 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.59 
 
 
308 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  37.84 
 
 
384 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0962  cytochrome c, class I  31.13 
 
 
101 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0656258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3416  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  31.65 
 
 
325 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.828991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>