18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1477 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1477  cytochrome c, class I  100 
 
 
108 aa  225  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2408  cytochrome c, class I  56.52 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1842  hypothetical protein  43.3 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.587463  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3478  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3836  putative p-cresol methylhydroxylase subunit  44.59 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2961  cytochrome c, class I  48.39 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428474  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1651  hypothetical protein  38.14 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  33.02 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3880  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  36.96 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1826  cytochrome c, class I  32.5 
 
 
251 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.384457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  25.21 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  38.24 
 
 
329 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1491  cytochrome c, class I  26.58 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  34.41 
 
 
255 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  27.4 
 
 
294 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2875  hypothetical protein  28.24 
 
 
134 aa  40.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.491169  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  29.17 
 
 
305 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>