15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2961 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2961  cytochrome c, class I  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428474  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1651  hypothetical protein  52.78 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1842  hypothetical protein  42.27 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.587463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1477  cytochrome c, class I  48.39 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223855  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3836  putative p-cresol methylhydroxylase subunit  47.06 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2408  cytochrome c, class I  36.19 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3478  hypothetical protein  38.03 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2123  hypothetical protein  34.38 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  40.32 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  35.21 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3005  cytochrome c class I  32.84 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2849  hypothetical protein  34.29 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  30.67 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  33.66 
 
 		 525 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>