71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3005 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3005  cytochrome c class I  100 
 
 
110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  84.68 
 
 
111 aa  184  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4979  cytochrome c-551  51.82 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3724  cytochrome c-551  50 
 
 
112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4880  cytochrome c-551  50.91 
 
 
107 aa  107  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5273  cytochrome c-551  50.91 
 
 
107 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717075 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5417  cytochrome c-551  50.91 
 
 
107 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4865  cytochrome c-551  50.91 
 
 
107 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5035  cytochrome c-551  50.91 
 
 
107 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5348  cytochrome c-551  49.09 
 
 
107 aa  103  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5291  cytochrome c-551  49.09 
 
 
107 aa  103  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5653  cytochrome c-551  48.18 
 
 
107 aa  103  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.432356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5303  cytochrome c-551  48.18 
 
 
107 aa  103  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0828  cytochrome c-550  54.35 
 
 
118 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000131619  hitchhiker  6.35976e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4408  cytochrome c-550  54.35 
 
 
118 aa  100  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4143  cytochrome c class I  53.26 
 
 
118 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000375642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4371  cytochrome c-550  53.26 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4425  cytochrome c-550  53.26 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000170237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4031  cytochrome c-550  52.17 
 
 
118 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4041  cytochrome c-550  51.09 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000123285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4193  cytochrome c-550  50 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000176262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4514  cytochrome c-550  50 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000708555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4313  cytochrome c-550  50 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74805e-54 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3018  cytochrome c class I  50 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  40.54 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  37.5 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  46.88 
 
 
254 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  49.23 
 
 
255 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  35.19 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  41.25 
 
 
769 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
330 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  34.33 
 
 
329 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1248  cytochrome c class I  42.19 
 
 
255 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1618  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  43.75 
 
 
255 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1546  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  43.75 
 
 
255 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  43.75 
 
 
255 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1434  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  43.75 
 
 
255 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0832764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1580  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  42.19 
 
 
255 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1687  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  42.19 
 
 
255 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.615326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1651  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  42.19 
 
 
255 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  46.55 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  42.19 
 
 
255 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3765  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  42.19 
 
 
255 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1449  cytochrome c class I  42.19 
 
 
255 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0848  cytochrome c class I  42.22 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.51 
 
 
731 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  43.55 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  35.14 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4247  hypothetical protein  29.35 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  35.62 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1823  hypothetical protein  31.97 
 
 
829 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  32.98 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  41.46 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  38.33 
 
 
704 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  32.93 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  34.29 
 
 
546 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  41.18 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  33.78 
 
 
701 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2961  cytochrome c, class I  31.88 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1911  hypothetical protein  35.53 
 
 
114 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.29 
 
 
747 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1716  hypothetical protein  34.21 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  43.55 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  44.83 
 
 
485 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  34.72 
 
 
517 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  32.1 
 
 
525 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  42 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1651  hypothetical protein  28.92 
 
 
109 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  29.33 
 
 
476 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  29.7 
 
 
154 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>