24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1651 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1651  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  221  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2961  cytochrome c, class I  58.14 
 
 
108 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1842  hypothetical protein  45.21 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.587463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1477  cytochrome c, class I  38.14 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223855  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3836  putative p-cresol methylhydroxylase subunit  39.13 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2408  cytochrome c, class I  41.1 
 
 
117 aa  57.8  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3478  hypothetical protein  35.29 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  30.59 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  27.18 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  30.34 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  28.16 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4514  cytochrome c-550  30.59 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000708555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4193  cytochrome c-550  30.59 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000176262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4313  cytochrome c-550  30.59 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74805e-54 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4041  cytochrome c-550  30.59 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000123285  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2875  hypothetical protein  31.11 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.491169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  32.47 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4031  cytochrome c-550  30.59 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040592  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0054  cytochrome c, class I  34.33 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  32.14 
 
 
270 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4143  cytochrome c class I  29.41 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000375642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1211  hypothetical protein  31.25 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4425  cytochrome c-550  29.41 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000170237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4371  cytochrome c-550  29.41 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>