15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1491 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1491  cytochrome c, class I  100 
 
 		 109 aa  224  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3880  hypothetical protein  43.37 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629035  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2875  hypothetical protein  32.53 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.491169  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  34.55 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  34.88 
 
 		 698 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  26.42 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  28.16 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  29.41 
 
 		 110 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1477  cytochrome c, class I  26.58 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1842  hypothetical protein  30.69 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.587463  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 268 aa  40.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.72 
 
 		 349 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  36.25 
 
 		 294 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>