39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_07721 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  100 
 
 
117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  88.89 
 
 
117 aa  211  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  46.34 
 
 
128 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  37.27 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  36.07 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  41.38 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  39.77 
 
 
125 aa  77  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  41.18 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  31.82 
 
 
111 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  37.35 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  29.63 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  32.95 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  31.9 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  31.46 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  28.44 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  30.28 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  28.44 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  30.49 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  29.36 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  31.03 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  31.19 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  31.03 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  28.41 
 
 
112 aa  52.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  33.7 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  31.65 
 
 
111 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  32.11 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  32.22 
 
 
124 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3841  cytochrome c variant  34.18 
 
 
230 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  31.65 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  25.69 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  32.95 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  32.58 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  32.47 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  29.55 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1491  cytochrome c, class I  26.42 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  33.78 
 
 
97 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  29.87 
 
 
120 aa  40.8  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  32.98 
 
 
287 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  32.43 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>