55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4618 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  100 
 
 		 111 aa  224  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  60.64 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  60.64 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  52.38 
 
 		 111 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  49.55 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  49.02 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  49.53 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  42.73 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  40.59 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  37.27 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  37.27 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  37.27 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  41.67 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  41.67 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  35.45 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  40.7 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  40.62 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  36.84 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  38.95 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  33.64 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  40 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  35.65 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  35.63 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  30.61 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  31.48 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  29.63 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  37.36 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  35.44 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  38.36 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  31.18 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  27.66 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  27.1 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  25 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  25 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  35.11 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  29.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  29.11 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3887  cytochrome c class I  30.59 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389814 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.57 
 
 		 298 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37509  predicted protein  25.53 
 
 		 151 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0501063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  34.67 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.12 
 
 		 289 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.12 
 
 		 289 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  23.66 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.8 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2405  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  30.12 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>