87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2744 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  100 
 
 		 121 aa  245  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  68.37 
 
 		 125 aa  140  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  53.51 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  48.04 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  48.7 
 
 		 111 aa  106  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  41.03 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  43.86 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  53.93 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  40.35 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  43.86 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  44.57 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  47.37 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  40.54 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  41.03 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  41.03 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  40.35 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  42.11 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  38.32 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  41.3 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  38.61 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  38.61 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  32.11 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  35.78 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  32.61 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  30 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  29.73 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  37.89 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  30.83 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  30.08 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.56 
 
 		 294 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  29.9 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  35.87 
 
 		 718 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  34.88 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.48 
 
 		 426 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.93 
 
 		 723 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  29.79 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 432 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  37.04 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  32.97 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.78 
 
 		 349 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1152  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.03 
 
 		 307 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67748  normal  0.0615842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  29.87 
 
 		 284 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  30.28 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5018  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.91 
 
 		 287 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2146  cytochrome c-550  29.9 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.117545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  27.36 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2992  cytochrome c class I  32.14 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169382  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  34.09 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  33.7 
 
 		 285 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  26.74 
 
 		 381 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.27 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.79 
 
 		 311 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0161  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.5 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.822245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  29.07 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0664  cytochrome c oxidase  31.25 
 
 		 287 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  30.53 
 
 		 432 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  28.95 
 
 		 1181 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  30.3 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0531  cytochrome c-550  25.71 
 
 		 170 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0845307  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  30.16 
 
 		 136 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2778  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.47 
 
 		 305 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  0.247491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  34.18 
 
 		 275 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5233  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.29 
 
 		 293 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2114  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.29 
 
 		 293 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  34.18 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  34.18 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  34.18 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  32.93 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  28.3 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0573  cytochrome c, class I  30.59 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0439994  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.25 
 
 		 308 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  29.41 
 
 		 329 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  29.49 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 975 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.71 
 
 		 312 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.11 
 
 		 308 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.4 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.4 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.41 
 
 		 1253 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  26.92 
 
 		 141 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  35.06 
 
 		 97 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 		 712 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 97 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>