43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18191 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  63.83 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  56.07 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  56.07 
 
 		 123 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  70.59 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  66.67 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  43.81 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  43.3 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  43.3 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  45.1 
 
 		 111 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  39.22 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  46.91 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  41.38 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  37.25 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  39.77 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  35.79 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  32.32 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  30.39 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  31 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  39.76 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  29.55 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  29.21 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  31.37 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  28.21 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  28.21 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  29.36 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  27.88 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  33.64 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  35.53 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  35.06 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  29.87 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  36.23 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  27.72 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  30.77 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  35.59 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  30.14 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  30.67 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  32.31 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  30.49 
 
 		 112 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1050  cytochrome c oxidase, subunit CcoP  35.16 
 
 		 326 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.26248  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  32.77 
 
 		 324 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>