38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0993 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  100 
 
 
104 aa  207  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  76.74 
 
 
112 aa  136  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  66.67 
 
 
125 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  61.63 
 
 
123 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  61.63 
 
 
123 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  60.24 
 
 
128 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  52.33 
 
 
113 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  52.33 
 
 
113 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  46.53 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  53.75 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  45.54 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  45.24 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  39.6 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  41.18 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  42.35 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  34.74 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  44.05 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  35.29 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  34.52 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  34.52 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  32.32 
 
 
111 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  36.36 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  33.7 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  29.29 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  29.76 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  35.06 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  35.06 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  32.56 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  33.77 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  32.11 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  29.81 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  40 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  32.98 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  35.21 
 
 
104 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  33.78 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  29.55 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  34.29 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  32.05 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>